Ablation은 라틴어에서 유래되었으며 파괴, 제거를 의미합니다. 우리가 심장질환(심장학)에서 사용하는 방법은 일반적으로 카테터 절제입니다. EPS 섹션에서 설명한 전극 카테터와 약간 다른 형태인 특수 카테터(절제 카테터)를 사용하여 심장에 부정맥을 유발하는 3~5mm의 영역을 파괴합니다. 예를 들어 이러한 방식으로 심계항진(빈맥)을 유발하는 초점을 제거함으로써 환자는 심계항진 문제를 제거합니다. 이 치료 방법은 EPS라는 절차를 연속적으로 수행하거나 두 번째 세션에서 수행됩니다. 프로세스는 EPS와 동일하게 진행됩니다. 환자는 두 시술의 차이를 구별할 수 없습니다. 절제에만 소요되는 시술 시간은 1~2시간 정도 소요될 수 있습니다. 그 이유는 빈맥을 일으키는 작은 초점이 있고 이를 소멸시키는 데 EPS보다 시간이 더 오래 걸리기 때문입니다. 파괴 과정은 고주파 전류로 가열하거나 극저온 에너지로 동결하여 수행됩니다. 절차는 기본적으로 고통스럽지 않습니다. 따라서 전신마취 하에서는 시행되지 않습니다. 시술 시간이 오래 걸리고 심장의 일부 부위가 약간 아프기 때문에 정맥 진정제가 더 자주 사용됩니다. 시술 후 환자는 심계항진을 완전히(약물 없이) 없앨 수 있습니다. 그런 점에서 이 치료법은 많은 질병에 대한 여러 치료법 중 완치(완전한 회복)를 제공할 수 있는 드문 치료법 중 하나이다.
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